食品与健康学院设食品科学与工程、食品质量与安全2个系，拥有包括“食品质量与安全北京实验室”、“食品风味化学北京市重点实验室”、“北京市食品添加剂工程技术研究中心”、“食品添加剂与配料北京高校工程研究中心”、“食品营养与人类健康北京高精尖创新中心”、“农产品质量安全追溯技术及应用国家工程实验室（联合）”、“中国-加拿大食品营养与健康联合实验室”在内的多个省市级实验室/工程研究中心。学院实验室总面积2000余平方米，拥有包括蛋白质晶体分析系统、高分辨飞行时间串联质谱在内的多台新型分析设备，设备总额超过2.5亿元。